Seguimiento de COVID-19 desde el Amazonas hasta Chicago

Los científicos de Northwestern Medicine Ramón Lorenzo-Redondo y el Dr. Egon Ozer voló recientemente al aeropuerto de Iquitos, una remota ciudad peruana en lo profundo de la selva amazónica a la que solo se puede acceder por avión o barco fluvial. Querían reunirse con médicos y científicos que brindan atención a las comunidades vecinas a lo largo del río Amazonas.

El motivo del reciente viaje: Iquitos tenía una alta incidencia de COVID-19 al inicio de la pandemia y querían entender cómo el relativo aislamiento de la gran ciudad incidía en la propagación de variantes virales en la región. Perú también tuvo la tasa de mortalidad por COVID-19 más alta durante toda la pandemia, especialmente dada la mortalidad muy alta observada durante las primeras fases de la expansión del SARS-CoV-2.

Los viajes de los científicos a través de América del Sur, que también incluyeron Lima, Perú y Santa Cruz, Bolivia, son un esfuerzo del Dr. Robert J. Havey, Instituto de Salud Global de la Universidad Northwestern, para expandir la red de secuenciación global del SARS-CoV. -2 en regiones donde hay poca o casi ninguna información genética viral. Quieren ayudar a capacitar a científicos sudamericanos y expertos en salud pública para realizar investigaciones locales.

Lorenzo-Redondo y Ozer forman parte de un equipo del Centro de Genómica de Patógenos y Evolución Microbiana (CPGME), que forma parte del Instituto Havey para la Salud Global. El equipo ha estado estudiando el virus en Chicago y en todo el mundo desde el comienzo de la pandemia. Su equipo ya ha trabajado con colaboradores en África, en los países de Nigeria, Malí y Guinea, para secuenciar cientos de especímenes de COVID-19 de regiones submuestreadas.

“Si miras el repositorio público mundial de todas las secuencias del SARS-CoV-2, menos del 1 % proviene del continente africano y menos del 2 % proviene de América del Sur”, dijo Ozer, director del CPGME. “Compare eso con América del Norte o Europa, donde se proporciona la gran mayoría de las secuelas. Esto conduce a enormes disparidades en el conocimiento de lo que circula en diferentes partes del mundo”.

Creando una colaboración global de científicos de COVID-19

Científicos se reunieron con médicos e investigadores en hospitales de Perú y Bolivia para apoyar el estudio de las variantes del SARS-CoV-2 en sus regiones. Esto incluye enviar algunas muestras a los EE. UU. para su secuenciación, pero también proporcionar equipos, suministros y capacitación a estas instituciones sudamericanas para que los científicos puedan rastrear el COVID-19 en sus países.

El objetivo es tener una red de colaboraciones en todo el mundo para que los científicos puedan trabajar juntos y compartir conocimientos e información para responder rápidamente a los nuevos desarrollos en la pandemia del SARS-CoV-2 y futuros brotes de patógenos emergentes o reemergentes.

«La aparición de una nueva variante en cualquier parte del mundo nos pone a todos en riesgo», dijo Judd Hultquist, profesor asistente de medicina en enfermedades infecciosas en la Facultad de Medicina Feinberg de la Universidad Northwestern y director asociado de CPGME. «La vigilancia oportuna a nivel internacional es fundamental para estar preparados cuando surja la próxima variante».

Cómo la alerta temprana Omicron de Sudáfrica ayudó a EE. UU.

Un ejemplo del buen funcionamiento de este sistema de alerta temprana es la detección temprana de omicron en Sudáfrica, incluso antes de que se detecte omicron en la mayoría de los países.

“Debido a que Sudáfrica estaba secuenciando de manera oportuna, pudieron hacer sonar la alarma un mes antes de que Chicago viera su primer caso de omicron”, dijo Hultquist.

La aparición de una nueva variante en cualquier parte del mundo nos pone en riesgo. ”

Este tiempo adicional fue fundamental para que los científicos aprendieran más sobre la variante, los riesgos que planteaba e implementaran estrategias de tratamiento adecuadas incluso antes de que llegara a los EE. UU.

Científicos sudafricanos descubrieron que muchos de los anticuerpos monoclonales (anticuerpos específicos administrados a pacientes en estado crítico para unirse a los virus y neutralizarlos) que se usan actualmente para los pacientes con COVID-19 no eran efectivos para la micra. Con esa alerta temprana, los médicos estadounidenses pudieron tratar a los pacientes con las terapias más efectivas.

El equipo de Northwestern ahora está recapitulando la historia de la pandemia en Chicago desde que se detectó el primer caso de COVID-19 en la ciudad. «Vamos a analizar los resultados clínicos frente a las variantes y la demografía», dijo Lorenzo-Redondo, profesor asistente de medicina en enfermedades infecciosas en Feinberg. “Queremos recopilar todos los datos para ver los factores que conducen a los peores resultados, las diferencias en las variantes y cómo se propaga el virus”.

Este estudio informará otros proyectos de investigación que se están iniciando en entornos de atención médica global.

El objetivo es encontrar similitudes y diferencias en estos factores para ayudar a diseñar estrategias de prevención efectivas global y localmente adaptadas a COVID-19, así como a otros patógenos virales en un futuro próximo.