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Patrones de distribución de elementos transponibles (TE), genes y contenido de GC en cromosomas de R. rosaefolius. Crédito: Investigación en horticultura (2024). DOI: 10.1093/h/uhae064
Rubus rosaefolius, una frambuesa roja, es valorada por sus propiedades nutricionales y medicinales, ya que contiene compuestos bioactivos como las antocianinas. A pesar de su potencial, la información genómica disponible es limitada.
Estudios anteriores se han centrado en taxonomía, fitoquímica y farmacología. Debido a estas lagunas, es necesario un estudio en profundidad de las bases genómicas y moleculares de importantes propiedades biológicas de las especies de Rubus.
Un estudiorealizado por investigadores de la Universidad de Kaili y el Jardín Botánico Provincial de Guizhou, publicado en Investigación en horticulturapresenta un borrador del genoma de Rubus rosaefolius a nivel cromosómico de alta calidad.
Mediante la secuenciación y el análisis del genoma y los transcriptomas, el estudio explora la dinámica evolutiva y los mecanismos moleculares subyacentes a la biosíntesis de antocianinas en esta frambuesa roja.
La secuenciación del genoma reveló 131 estructuras ensambladas, 70 de las cuales estaban ancladas en siete pseudocromosomas, cubriendo el 99,33% del tamaño estimado del genoma. El estudio identificó un evento de duplicación compartido de todo el genoma entre los miembros de la familia de las Rosáceas, lo que dio lugar a 5.090 pares de genes duplicados detectables, de los cuales aproximadamente el 75% se sometió a una selección purificadora.
Se detectaron varias antocianinas en las bayas, cuyas concentraciones aumentaron significativamente durante la maduración. Se han identificado genes estructurales clave como RrDFR, RrF3H, RrANS y RrBZ1 como cruciales en la biosíntesis de antocianinas.
La expresión de estos genes se correlacionó con la acumulación de las principales antocianinas, como pelargonidina-3-O-glucósido y pelargonidina-3-O-(6''-O-malonil) glucósido. Además, se ha descubierto que los factores de transcripción y los genes que codifican la metilasa regulan la biosíntesis de antocianinas dirigiéndose a genes estructurales.
Yunsheng Wang, investigador principal de la Universidad de Kaili, dijo: «Nuestros hallazgos proporcionan información completa sobre la evolución genómica y los mecanismos moleculares de la biosíntesis de antocianinas en Rubus rosaefolius. Este conocimiento es fundamental para la domesticación y la cría específica de especies de Rubus, mejorando su nutrición y comercial. valor.»
La investigación allana el camino para el desarrollo de cultivares de Rubus con mayor contenido de antocianinas, revolucionando potencialmente el papel de la fruta en la salud dietética y contribuyendo al avance de los programas de mejoramiento de frutas silvestres en todo el mundo.
Mas informaciones:
Yunsheng Wang et al, El genoma a escala cromosómica junto con el transcriptoma y el metaboloma proporciona información sobre la evolución y biosíntesis de antocianinas de Rubus rosaefolius Sm. Investigación en horticultura (2024). DOI: 10.1093/h/uhae064
