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La IA puede desbloquear el lenguaje de las proteínas: conoce a Ankh, el susurrador de proteínas

¿Y si la IA pudiera hablar con las proteínas? Ya sabes, ¿esas moléculas grandes y complejas que desempeñan tantos papeles críticos en el cuerpo? Bueno, guarde sus batas de laboratorio, porque Ankh, un nuevo modelo de lenguaje de proteínas, tiene como objetivo hacer precisamente eso.

Ankh fue creado por un grupo de expertos de las Universidades de Munich y Columbia en colaboración con la empresa de biotecnología proteína. El nombre proviene de un antiguo símbolo egipcio que representa la vida, adecuado para un modelo de lenguaje de IA que profundiza en los componentes básicos de la vida.

de acuerdo a un trabajo de investigaciónr, Ankh aprende el «lenguaje de las proteínas» analizando un gran conjunto de datos de secuencias de proteínas, luego usa ese conocimiento para crear nuevas secuencias de proteínas y luego intenta determinar cómo podrían funcionar.

Un modelo de lenguaje proteico como Ankh y un modelo de lenguaje grande como ChatGPT son similares. En las proteínas, el alfabeto consta de aminoácidos. Estos aminoácidos se unen para formar cadenas, como palabras. La secuencia de aminoácidos debe estar en un orden específico para que la proteína se pliegue en la forma 3D correcta, lo cual es esencial para su función. Básicamente, es cómo las personas juntan palabras en un idioma específico, siguiendo un conjunto de reglas para comunicarse correctamente.

Un modelo de lenguaje grande funciona tratando de predecir qué palabra tendría más sentido en un resultado en particular dado un aviso, y Ankh básicamente intenta hacer lo mismo, adivinando qué configuración biológica tendría más sentido para un resultado en particular dado todo lo que sabemos. sobre las proteínas y sus reglas estructurales.

Comprender las proteínas (y su lenguaje) es crucial para la biología humana. Desempeñan un papel clave en la estructura, función y regulación de los tejidos y órganos del cuerpo.

La capacidad de Ankh para analizar y predecir el comportamiento de las proteínas podría resultar extremadamente útil en los campos de la medicina, las ciencias ambientales y más. Por ejemplo, en el descubrimiento de fármacos, Ankh se puede utilizar para predecir cómo las proteínas interactuarán con varios compuestos, lo que puede acelerar significativamente el desarrollo de nuevos fármacos.

Además, podría ayudar a los científicos a comprender cómo las mutaciones en las proteínas pueden provocar enfermedades, lo cual es invaluable en la investigación genética.

Además de la medicina, Ankh tiene aplicaciones en biología sintética, donde puede usarse para diseñar nuevas proteínas que muestren las funciones deseadas. Esto tiene implicaciones de gran alcance para campos como la energía renovable y la ciencia de los materiales. Al diseñar proteínas que pueden, por ejemplo, descomponer plásticos o producir biocombustibles de manera más eficiente, Ankh puede contribuir a resolver algunos de los desafíos ambientales más apremiantes de nuestro tiempo.

Usos para Ankh. Imagen: Arvix.org

Como informó recientemente descifrar, OpenAI, el gigante de IA conocido por desarrollar el generador de imágenes de difusión estable, no es ajeno al mundo de las proteínas. También están incursionando en la IA para la investigación de proteínas. Con Ankh también en escena, parece que la IA está calentando el campo de la investigación, haciendo que las proteínas sean lo más interesantes posible.

anj es disponible públicamente y se distribuye bajo la licencia CC BY-NC-SA 4.0, así que si quieres hablar con tus proteínas, hazlo.

¿Qué sigue para Ankh? Los investigadores tienen los labios apretados, pero podemos esperar un rápido desarrollo de nuevas funciones y mejoras. ¿Qué pasa con Chaos-GPT, la IA empeñada en dominar el mundo? Podría considerar asociarse con Ankh. Porque, seamos realistas: las proteínas gobiernan el mundo.

Federico Pareja

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